léëéçêéå=î~å=òáéâíéãéêâéêë=áå=äáçñäìáçë=çççê=ãáççéä= î~å=kjo=ëééåíêçëåçéáé - PDF Free Download (2024)

léëéçêÉå=î~å=òáÉâíÉãÉêâÉêë=áå=ÄáçÑäìáÇë=Çççê=ãáÇÇÉä= î~å=kjo=ëéÉÅíêçëÅçéáÉ

mÉíÉê=oba^kq éêçãçíçê=W mêçÑK=ÇêK=gç~ååÉë=dbi^kI=ÇêK=mÉíÉê= ^aof^bkpbkp ÅçJéêçãçíçê=W mêçÑK=ÇêK=j~êáÉ=s^kabopqbbk

báåÇîÉêÜ~åÇÉäáåÖ=îççêÖÉÇê~ÖÉå=íçí=ÜÉí=ÄÉâçãÉå=î~å=ÇÉ=Öê~~Ç= j~ëíÉê=áå=ÇÉ=ÄáçãÉÇáëÅÜÉ=ïÉíÉåëÅÜ~ééÉå=~ÑëíìÇÉÉêêáÅÜíáåÖ= âäáåáëÅÜÉ=Éå=ãçäÉÅìä~áêÉ=ïÉíÉåëÅÜ~ééÉå

Inhoudstafel Inhoudstafel.................................................................................................................................I Lijst met gebruikte afkortingen .................................................................................................. 1 Voorwoord ................................................................................................................................. 2 Samenvatting.............................................................................................................................. 3 Hoofdstuk 1: Inleiding ............................................................................................................... 4 1.1 Immunologie, etiologie en pathogenese van multiple sclerose........................................ 4 1.2 Experimentele autoimmune encephalomyelitis (EAE) .................................................... 5 1.3 Metabonomica.................................................................................................................. 6 1.4 Metabolietveranderingen bij MS...................................................................................... 7 1.4.1 Hersenmetabolieten................................................................................................... 7 1.4.2 Urinaire metabolieten.............................................................................................. 10 1.5 Onderzoeksopzet ............................................................................................................ 10 Hoofdstuk 2: Principe NMR spectroscopie.............................................................................. 12 2.1 Het hoofdmagneetveld B0 en de stoorzender B1 ............................................................ 12 2.2 Relaxatie......................................................................................................................... 14 2.2.1 Longitudinale relaxatie............................................................................................ 14 2.2.2 Transversale relaxatie.............................................................................................. 15 2.3 Chemische shift .............................................................................................................. 16 2.4 J-koppeling ..................................................................................................................... 16 2.5 Uitzicht NMR spectrum ................................................................................................. 17 Hoofdstuk 3: Optimalisatie staalbereiding en NMR parameters ............................................. 18 3.1 pH urine.......................................................................................................................... 18 3.2 Concentratie urinestalen................................................................................................. 19 3.3 Staalvoorbereiding ......................................................................................................... 20 3.4 Wegwerken brede basislijn ............................................................................................ 20 3.4.1 Centrifugatie............................................................................................................ 21 3.4.2 Filtratie .................................................................................................................... 21 3.4.3 Ionensterkte en uitzouting ....................................................................................... 22 3.4.4 Zure hydrolyse......................................................................................................... 22 3.4.5 Fase scheiding ......................................................................................................... 22 I

3.4.6 Protonuitwisseling met D2O.................................................................................... 22 3.4.7 Resultaten en conclusie ........................................................................................... 23 3.5 1H NMR.......................................................................................................................... 23 Hoofdstuk 4: Opsporen ziektemerkers..................................................................................... 24 4.1 Materiaal en methoden ................................................................................................... 24 4.1.1 Staalname ................................................................................................................ 24 4.1.2 Stockoplossing van interne referentie in D2O ......................................................... 26 4.1.3 1H NMR................................................................................................................... 26 4.1.4 Spectrale analyse ..................................................................................................... 26 4.2 Resultaten ....................................................................................................................... 28 4.2.1 Chemische shift van metabolieten in urine ............................................................. 28 4.2.2 Ziektemerkers in urine ............................................................................................ 28 4.3 Discussie en toekomstperspectieven .............................................................................. 39 5. Conclusie.......................................................................................................................... 41 Referenties................................................................................................................................ 42 Bijlage ...................................................................................................................................... 46

II

Lijst met gebruikte afkortingen a.u.:

Arbitraire eenheid

CFA:

Complete Freund’s adjuvant

Cho:

Choline

Cn:

Creatinine

Cr:

Creatine

D2O:

Gedeutereerd water (1H in water is vervangen door deuterium, 2H)

EAE:

Experimentele autoimmune encephalomyelitis

Gln:

Glutamine

Glt:

Glutamaat

GPC:

Glycerofosfocholine

Hz:

Herz

1

Proton nucleaire magnetisch resonantie

H-NMR:

IFN-γ :

Interferon γ

IL:

Interleukine

Ino:

Inositol

MBP:

Myelin basic protein

MS:

Multiple sclerose

NAA:

N-acetyl aspartaat

NO:

Stikstof oxide

PC:

Fosfocholine

PP:

Primair progressief

ppm:

Parts per million (chemische shift δ )

RR:

Relapsing remitting

SP:

Secundair progressief

TGF-β:

Transforming growth factor β

TNF-α:

Tumor necrosis factor α

TSP:

3-trimethylsilyl-2,2,3,3-tetradeuteropropionaat

δ:

Chemische shift in ppm (parts per million)

1

Voorwoord Vooreerst zou ik mijn promotoren dr. Peter Adriaensens en Prof. dr. Jan Gelan en copromotor Prof. Dr Marjan Vandersteen willen bedanken die mij de kans boden deze stage te volbrengen. Hierbij wil ik dr. Peter Adriaensens en dra. Evi Theunissen oprecht bedanken voor de begeleiding en het geduld dat vaak nodig was tijdens mijn stage. Verder bedank ik ook dr. Liesbet Storme en wens haar veel geluk toe met haar dochter Nette. Verder bedank ik dr. Frank Vandenabeele die het mogelijk maakte om urinestalen van MS patiënten te verzamelen. Hierbij wil ik dan ook de personen vermelden die mij urinestalen bezorgden, in het bijzonder de patiënten zelf en de gezonde controles. Ook dien ik Kurt Baeten te vermelden voor zijn onmisbare hulp die ik kreeg tijdens het induceren van EAE in ratten en het klinisch scoren van deze dieren. Als laatste zou ik mijn vrienden, vriendin en ouders willen vermelden voor de nodige ondersteuning, waar het nodig was.

2

Samenvatting Inleiding: Multiple sclerose (MS) is een autoimmune inflammatoire aandoening van het centrale zenuwstelsel. Waarschijnlijk speelt een afwijkend immuunsysteem een centrale rol in het ziekteproces. Via het diermodel EAE is het mogelijk om onderzoek te doen naar de oorzaken en mechanismen van MS. Door middel van in vivo 1H-NMR spectroscopie van hersenen zijn reeds verschillen in metabolieten beschreven tussen gezonde en zieke individuen. Analyse van biofluids, zoals urine, met 1H-NMR spectroscopie heeft tegenover in vivo metingen voordelen zoals de eenvoudige en niet-invasieve staalname. In dit werkstuk zal getracht worden om ziektemerkers voor MS op te sporen met behulp van 1H-NMR spectroscopie van humane urine en urine van EAE ratten. Materiaal en methoden: Urinestalen van MS patiënten werden vergeleken met urinestalen van gezonde controles. Tevens werden veranderingen in urinestalen in functie van het ziekteverloop bij EAE ratten onderzocht. Na de nodige staalbereiding gebeurde de analyse met 1H-NMR spectroscopie waarna vervolgens de bekomen data werd verwerkt ter opsporing van ziektemerkers. Resultaten: Op top van de ziekte werden bij EAE ratten, in vergelijking met gezonde ratten, verschillen gevonden voor glutamaat/glutamine, creatine, choline, phenylacetylglycine, αketoglutaraat, leucine en/of valine, dimethylamine, glycine en citraat. Bij MS patiënten werden verschillende waarden voor creatinine, creatine, leucine en/of valine, citraat en inositol gevonden in vergelijking met gezonde personen. Conclusie: Via 1H-NMR spectroscopische analyse van urine lijkt het mogelijk om verschillen in welbepaalde metabolieten te detecteren tussen gezonde en zieke (EAE, MS) individuen. Deze bieden opportuniteiten als diagnosemerkers en kunnen mogelijk ook bijdragen aan het ontrafelen van het ziektemechanisme. Het bevestigen van deze potentiële merkers aan de hand van een grotere populatieset lijkt daarom zeker opportuun.

3

Hoofdstuk 1: Inleiding 1.1 Immunologie, etiologie en pathogenese van multiple sclerose Multiple Sclerose (MS) is een autoimmune aandoening van het centrale zenuwstelsel, gekarakteriseerd door chronisch inflammatie, demyelinisering en gliose. Typerend voor deze ziekte zijn de zogenaamde MS lesies. In post-mortem hersenweefsel zijn deze plaques duidelijk zichtbaar als afgebakende gebieden van demyelinisatie in de witte hersenmassa, al dan niet gepaard gaande met axonale schade. Met uitzondering van trauma’s is MS de meest voorkomende oorzaak van neurologische afwijkingen bij jonge volwassenen. Kenmerkende symptomen zijn onder andere verlammingen, zwakheid, gevoelsverlies, tintelingen en optische neuritis [1] . De eerste tekenen van deze aandoening manifesteren zich meestal tussen de ouderdom van 20 en 40 jaar. Deze ziekte komt beduidend meer voor bij vrouwen dan bij mannen [2]. Een afwijkend immuunsysteem speelt vermoedelijk een centrale rol in de pathogenese van deze ziekte. Myeline reactieve T-cellen worden perifeer geactiveerd door vreemde (mogelijk virale) epitopen of lichaamseigen antigenen. Eens geactiveerd kunnen deze T cellen doorheen de bloed-hersen-barrière migreren waardoor ze de mogelijkheid bezitten om in het centrale zenuwstelsel binnen te dringen. Eenmaal in het centrale zenuwstelsel kunnen deze cellen gereactiveerd worden door neurologische antigenen zoals myelin basic protein (MBP). Vervolgens secreteren deze gereactiveerde T-cellen pro-inflammatoire cytokines zoals IFN-γ en interleukine 2 (IL-2). Deze cytokines spelen een rol bij de destructie van de myelineschede. In de literatuur wordt een onderscheid gemaakt tussen vier verschillende pathologische patronen bij MS: (i) T-cell en macrofaag gemedieerde demyelinisatie; (ii) antilichaam gemedieerde

demyelinisatie

waarbij

complement

geactiveerd

wordt;

(iii)

distale

oligodendrogliopathie en oligodendrociet apoptose; (iv) primaire oligodendrociet degeneratie. De eerste twee patronen veronderstellen dat het de myeline zelf is die in eerste instantie beschadigd wordt waar het bij de laatste twee patronen het de oligodendrociet in weze is die beschadigd wordt. In een laatste fase van de ziekte kan naast demyelinisatie ook axonale schade optreden [3].

4

Algemeen wordt een onderscheid gemaakt in twee vormen van MS. De meest frequente vorm (85% - 90%) is de relapsing-remitting (RR)-MS. De meeste van deze patiënten evolueren later naar een secundaire progressieve vorm (SP-MS) (zie figuur 1). Een klein aantal patiënten (10%-15%) bevindt zich onmiddelijk in een primair progressieve vorm (PP-MS). Welke factoren juist instaan voor de verschillende ziekteverlopen zijn nog niet gekend. De opsporing van markers, die in staat stellen om MS tijdig te kunnen diagnostiseren, is belangrijk voor het starten

van

passende

therapieën

zoals

toediening

van

anti-inflammatoire

en

immunomodulatoire medicaties [2].

Figuur 1. Schematische voorstelling van de klinische evolutie van MS. EDSS: expanded disability scale scores, deze schaal geeft een waarde van 0 tot 10 aan de mate van handicap ten gevolge van MS. T1 gad: frequentie van inflammatoire events, gedetecteerd in MRI opnames (T1 lesies met contrast stof). Lesion load T2: aantal T2 lesies die algemene weefselschade aangeven. Brain volume atrophy measures: hersenvolume[2].

1.2 Experimentele autoimmune encephalomyelitis (EAE) Experimentele autoimmune encephalomyelitis (EAE) in de rat is een acute vorm van paralyse waarvan de meeste dieren spontaan herstellen. Dit diermodel vertoont grote gelijkenis met de inflammatie die optreedt bij MS. EAE kan geïnduceerd worden door de ratten te immuniseren met myelin basic protein (MBP) of andere myeline eiwitten in combinatie met complete Freund’s adjuvant (CFA). De ziekte wordt gekarakteriseerd door mononucleaire celinfiltratie in het ruggenmerg, de hersenstam en het cerebellum. Demyelinisatie is zeer ongewoon. Encephalitogene CD4+ T-cellen blijken aanwezig te zijn 5 dagen na immunisatie. Op dag 7 zorgt geproduceerd IFN-γ dat deze T-cellen doorheen de bloed-hersen-barrière migreren. Eens hier aangekomen recruteren ze macrofagen, microgliacellen en T-cellen. Deze zetten onder andere NO, TNF-α en componenten van de stollingscascade vrij. Het gevolg hiervan is het ontstaan van oedeem dat samen met veranderingen in de bloed-hersen-barrière 5

hoogstwaarschijnlijk voor de verlammingsverschijnselen zorgt. Het genezingsproces kan gereguleerd worden door suppressor cellen die TGF-β secreteren. Dit TGF- β is immers in staat om de werking van welbepaalde pro-inflammatoire cytokines af te remmen [4].

1.3 Metabonomica Een opkomende techniek die het mogelijk maakt om biologische processen beter te begrijpen is de techniek van de metabonomica. De metabonomica houdt zich bezig met de kwantitatieve beschrijving van laagmoleculaire endogene metabolieten, aanwezig in biologische stalen zoals urine, plasma, weefsel [5], bloed, cerebrospinaal vocht en gal. Meestal wordt hiervoor gebruik gemaakt van lichaamsvloeistoffen. Metabolieten in lichaamsvloeistoffen zijn meestal in dynamisch evenwicht met de metabolieten in de cel en weefsels. Abnormale cellulaire processen in cellen zullen zich dan ook reflecteren in afwijkende metabolietconcentraties in deze lichaamsvloeistoffen. Urine lijkt hiervoor zeer geschikt aangezien een staal niet invasief en vrij eenvoudig te verkrijgen is [6]. Waarentegen bloed enkel een snapshot laat zien van het metabolisme, laat urine metabole veranderingen zien over een langer tijdsinterval. Metabolietconcentraties in het bloed worden binnen nauwe grenzen gehouden in tegenstelling tot metabolieten in urine die geconcentreerd kunnen voorkomen [7]. De nier speelt een belangrijke rol in de lichaamshomeostase door de eliminatie van afvalproducten. De variatie van componenten in de urine is een reflectie van de verschillende biochemische processen in de nier en de rest van het lichaam. Analyse van urine (urinalyse) kan daarom diagnostisch van zeer groot belang zijn. In urine zitten componenten zoals organische zuren en basen, eenvoudige suikers, polysachariden, heterocyclische componenten, polyolen, laag moleculaire proteïnen en polypeptiden. Ook anorganische componenten zoals Na+, K+, Ca2+, Mg2+, HCO3, SO42- en fosfaten worden in de urine aangetroffen. Hoge resolutie 1H nucleaire magnetische resonantie (NMR) spectroscopie (NMRS) is een zeer geschikte methode voor de analyse van organische componenten in lichaamsvloeistoffen zoals urine. Deze uiterst snelle manier van analyseren vergt weinig staalvoorbereiding. Ook is het niet nodig om reeds een voorselectie te maken van welbepaalde componenten en kan er in één keer op een heel gamma van metabolieten gescreend worden. Er kan als het ware een metaboliet fingerprint (zie figuur 2) van een individu gemaakt worden. NMR spectroscopische analyses zijn tevens niet destructief en vergen maar een lage hoeveelheid staal [6]. De te onderzoeken metabolieten moeten echter wel waterstofatomen bevatten, aangezien het deze protonen zijn die voor het detecteerbaar signaal zorgen. Een van voornaamste

problemen

die

opduiken

bij

NMR

spectroscopische

analyses

van 6

lichaamsvloeistoffen zijn overlappingen tussen pieken en de aanwezigheid van een breed achtergrondsignaal. Het spreekt dan ook voor zich dat de spectra van urine van zeer complexe aard zijn.

10

9

8

7

6

5

4

3

2

1

δ (ppm)

Figuur 2. Klassieke NMR spectroscopische opname van urine van een gezonde proefpersoon

1.4 Metabolietveranderingen bij MS 1.4.1 Hersenmetabolieten Door middel van gelocaliseerde in vivo NMR spectroscopie van humane hersenen is het mogelijk om metabolieten te detecteren zoals creatine (Cr) N-acetyl aspartaat (NAA), choline (Cho) (zie figuur 3). Tevens is het mogelijk om andere componenten waar te nemen zoals myo-inositol, glutamaat en glutamine [8]. De piek van creatine (3,05 ppm) blijkt afkomstig van creatine zelf als van fosfocreatine. Deze laatste twee metabolieten zijn belangrijk in de energie homeostase. Deze piek wordt vaak gebruikt als referentie waardoor metaboliethoeveelheden vaak uitgedrukt worden in een ratio met de piekhoogte of piekoppervlakte van de creatinepiek in de noemer. Wel dient opgemerkt te worden dat ofschoon creatine vaak als referentie gebruikt wordt, er melding [9, 10] gemaakt wordt van veranderingen in creatine hoeveelheden in hersenen. Veranderingen uitdrukken

ten

opzichte

van

creatine

kan

dus

een

fout

beeld

scheppen

van

metabolietveranderingen in hersenen. Het aminozuurderivaat NAA blijkt enkel aanwezig te zijn in neuronen en axonen van mature hersenen [8, 11, 12] en O-2A progenitorcellen [12]. Deze laatste zijn progenitorcellen van oligodendrocyten [13]. Waarschijnlijk fungeert NAA als een watertransporter waarbij door

7

elke molecule 32 watermoleculen uit de neuronen tegen de watergradiënt in getransporteerd worden. Op deze wijze speelt NAA dus een rol in osmoregulatie. Buiten het neuron wordt NAA gedeacetyleerd door enzymes in oligodendrocyten zoals amidohydrolase II. Afwezigheid van deze deacetylerende enzymes kan zich uiten in de ziekte van Canavan, gekenmerkt door verhoogde hoeveelheden NAA in de hersenen. Het aspartaat kan opnieuw in een neuron gebracht worden waarna het na acetylering tot NAA in het neuron opnieuw dienst doet als transporter voor watermoleculen [11]. Mogelijk speelt NAA ook een rol in proteïne synthese en metabolisme van neurotransmitters zoals aspartaat en N-acetyl glutamaat [14]. Gezien zijn functie in neuronen wordt NAA beschouwd als een merker voor axonale integriteit in MS [11, 14]. Een studie toont aan dat er een verband bestaat tussen de klinische score en de NAA:creatine ratio in welbepaalde gebieden in hersenen van relapsing-remitting patiënten [12]. Hier dient opgemerkt te worden dat deze verandering in NAA:creatine eerder te wijten kan zijn aan een daling van creatine dan een stijging van NAA. Een andere studie vond een verlaging van NAA in normale witte stof van MS patiënten door de absolute hoeveelheid van NAA te bepalen (dus niet ten opzichte van creatine). Ook in deze studie [9] werd een verband aangetoond tussen de verandering van NAA en de EDSS schaal. Een andere studie wijst dan weer op een vermindering in NAA in acute lesies t.o.v. chronische lesies en normaal-lijkende witte stof [15]. Het choline signaal blijkt afkomstig van glycerofosfocholine (GPC), fosfocholine (PC) en vrij choline [8]. PC is een precursor van de fosfolipiden fosfatidylcholine en sfingomyeline. Deze fosfolipiden zitten ingebouwd in cel- en myelinemembranen in het centrale zenuwstelsel. GPC is daarentegen een afbraakproduct van fosfatidylcholine. Er werd reeds een stijging in de choline:creatine ratio vastgesteld in MS patiënten [16]. Ook hier dient opgemerkt te worden dat deze verandering in choline:creatinine eerder te wijten kan zijn aan een daling van creatine dan een stijging van choline. Een andere studie wijst op hogere hoeveelheden choline in acute MS lesies dan in chronische lesies [15]. Algemeen wordt choline als een merker voor demyelinisatie aanschouwd [17]. In normale humane hersenen is lactaat moeilijk te detecteren aangezien de concentraties vaak onder de detectielimiet zitten. Verhoogde concentraties aan lactaat worden meestal gevonden in toestanden van een ontregeld energiemetabolisme. Zo wordt onder andere een verhoging aangetroffen bij ischemie en hersentumoren [8]. Ook is reeds een verhoogd lactaat signaal beschreven in MS lesies, positief voor gadolinium (Gd) [18]. Een andere studie toont een

8

stijging van lactaat in acute MS lesies. Deze stijging zou te wijten zijn aan de metabole activiteit van de inflammatoire cellen [10]. Myo-inositol wordt beschouwd als een merker voor gliale activiteit. Er werd een verhoogde myoinositol concentratie aangetroffen in acute MS lesies [15]. Over de ware functie van deze component is voorlopig nog veel onduidelijkheid. Samen met lactaat zijn er nog veranderingen in inositol gerapporteerd in MS-patiënten in vergelijking met gezonde personen [16]. Glutamaat en glutamine zijn zichtbaar als één gemeenschappelijke piek in het NMR spectrum. Glutamaat wordt door neuronen in de synaptische spleet vrijgezet als neurotransmitter. Om neurotoxiciteit te voorkomen internaliseren astrocyten de glutamaat nadien en zetten het terug vrij in de vorm van glutamine. Het is dit glutamine wat dan door de neuronen opnieuw wordt opgenomen om dan nadat het omgezet is naar glutamaat opnieuw dienst te doen als neurotransmitter. Er werden reeds verhoogde glutamaat concentraties aangetroffen in acute lesies en normaal-lijkende witte stof van MS patiënten [15].

Figuur 3. Proton NMR spectroscopische opname met een echotijd van 136 milliseconden van normaal hersenweefsel. De pieken van N-acetyl aspartaat (NAA), choline (Cho) en creatine (Cr) zijn duidelijk zichtbaar [19].

9

1.4.2 Urinaire metabolieten Er zijn aanwijzingen in de litteratuur dat EAE, geïnduceerd in de primaat Callithrix jacchus, geassocieerd is met metabolietveranderingen in urine. In deze studie werden apen geïmmuniseerd met humaan myeline. Hierbij viel vooral op dat deze apen, wanneer ze volop klinische symptomen vertoonden van EAE, meer NAA, choline, inositol en neopterine in de urine vertoonden. Deze laatste component wordt beschouwd als een merker voor inflammatie. Ook werd in deze studie een sterke aanwijzing gevonden dat er ook verschillen aanwezig zijn in urinaire metabolieten van MS patiënten ten opzichte van gezonde personen en patiënten met andere neurologische aandoeningen [17]. Een andere studie toont aan dat het mogelijk is om inflammatie, geïnduceerd in de hersenen, op te sporen in urine. In deze studie werden bij ratten adenovirussen die enerzijds TNF-α en anderzijds IL1-β tot expressie brengen ingebracht in de hersenen. Hierdoor werd een lokale inflammatoire reactie in de hersenen bewerkstelligd. Injectie van een welbepaald adenovirus bracht een specifiek type ontsteking tot ontwikkeling. Hierbij werd niet alleen een verschil gevonden tussen een rat met herseninflammatie en een naiëve rat maar werden in de urine zelfs verschillen aangetoond tussen de verschillende types ontstekingen onderling. De IL1-β groep vertoonde een verhoogde hoeveelheid leucine, isoleucine, valine, n-butyraat en glucose waarentegen de TNF-α groep verhoogde hoeveelheden citraat, 2-oxoglutaraat en succinaat vertoonde [7].

1.5 Onderzoeksopzet Eerder werd reeds aangehaald dat spectroscopie van hersenweefsel verschillen aantoont in welbepaalde organische metabolieten tussen MS patiënten en gezonde individuen. Nadelen aan deze methode zijn onder andere de lage reproduceerbaarheid van de resultaten, de lage resolutie en de lage detectielimiet. Ook wordt er met dit type spectroscopie zeer lokaal gekeken naar metabolietconcentraties. Tevens bestaat er in de literatuur geen éénduidig standpunt omtrent metabolietconcentraties bij MS patiënten ten op opzichte van niet-MS personen. NMR spectroscopie van lichaamsvloeistoffen, meerbepaald urine, kan hier misschien uitweg bieden. Het voordeel aan deze techniek is onder andere de hogere resolutie en gevoeligheid die verkregen kan worden. In tegenstelling tot hersenbiopten zijn urinestalen bovendien veel eenvoudiger te verkrijgen. Waar bij in vivo spectroscopie zeer lokaal gekeken wordt naar eventueel primaire oorzaken van MS, kan bij NMR spectroscopische analyse van

10

urine meer systemisch gezocht worden naar secundaire gebeurtenissen bij MS. Dit vergroot de kans op het vinden van geschikte merkers die in staat stellen MS vroegtijdiger te diagnostiseren. Door toevoeging van een interne standaard aan urine is het tevens mogelijk om stalen onderling eenvoudiger te vergelijken en het gebruik van het veelgebruikte creatine 1

H NMR signaal (3,05 ppm) als interne referentie kritisch te evalueren.

Eerst werd een optimale urine staalvoorbereiding en 1H NMR spectroscopische analyse op punt gesteld. Vervolgens werd getracht om de brede resonantiepieken die zorgen voor een breed achtergrondsignaal in het 1H NMR spectrum van urine te elimineren. Na deze optimalisatie werd getracht om eventuele ziektemerkers voor MS op te sporen door zeer systematisch de urine van gezonde en zieke individuen te vergelijken. Hierbij worden alle stalen onder dezelfde omstandigheden bereid (zelfde pH waarde, concentratie buffer,...) en geanalyseerd onder identieke opname condities (zelfde pulssequentie, preparatietijd, acquisitietijd, interne referentie,...). Vooreerst zullen verschillen in urinaire metabolieten gezocht worden, gebruik makende van het EAE ratmodel van MS. Deze manier van onderzoek stelt ons in staat om zeer gecontroleerd variatie tussen zieke en gezonde individuen op te sporen. De dieren krijgen onder andere namelijk dezelfde voeding en zijn niet onderhevig aan medicatiegebruik. Als uiteindelijk doel zal ook getracht worden om afwijkende metabolietprofielen aan te tonen in urinestalen van MS-patiënten ten opzichte van gezonde personen.

11

Hoofdstuk 2: Principe NMR spectroscopie 1

H

NMR

spectroscopie

bestudeert

magnetische

eigenschappen

van

kernen

van

waterstofatomen, ingebouwd in moleculen.

2.1 Het hoofdmagneetveld B0 en de stoorzender B1 Net zoals electronen beschikken ook protonen en neutronen over een spin. Anders gezegd zijn dit ook spin ½ deeltjes. Het kernspinkwantumgetal I van een kern, is een maat voor de vectoriële som van deze spins van de neutronen en protonon in de kern. Hierbij is het mogelijk dat 2 protonen en 2 neutronen elkaars spin neutraliseren. I beschrijft dus de som van de niet-geneutraliseerde neutronspins en protonspins. Het zijn nu kernen met een I ≠ 0 die NMR gevoelig zijn. Voorbeelden hiervan zijn onder andere 1H (I=1/2) en 13C (I=1/2). Zulke kernen kunnen beschouwd worden als kleine magneetjes met een kernmagnetisch r dipoolmoment μ . Brengt men een I=1/2 kern met zijn magnetisch moment in een sterk en homogeen uitwendig magnetisch veld B0, dan kan de kern energetisch gezien in twee toestanden voorkomen: een lage energietoestand (spin-up of α-toestand) waarbij μz parallel is aan B0 en een hoge energietoestand (spin-down of β-toestand) waarbij μz antiparallel is aan B0 (zie figuur 4).

Figuur 4. Verschillende energietoestanden van de I=1/2 kern onder invloed van een uitwendig magnetisch veld B0. B

Onder invloed van B0, gericht langs bijvoorbeeld de Z-as, beschrijft een kernvector eigenlijk een cirkelvormige beweging rond B0 die de oppervlakte van een kegel beschrijft. De frequentie van deze tolbeweging ,de Larmorfrequentie, kan als volgt beschreven worden:

12

ωL = γ B0 of ν L =

γ B0 2π

Hierbij is γ de gyromagnetische constante eigen aan het 1H atoom. Tussen de twee energieniveaus

kunnen

spinovergangen

geïnduceerd

worden

door

instraling

met

electromagnetisch straling van de geschikte frequentie. Er moet aan de zogenaamde resonantievoorwaarde voldaan zijn: E = hν = hν L = h

γ B0 = ΔE 2π

Hierbij is h de constante van planck en ∆E het energieverschil tussen de twee energietoestanden. De spinovergangen kunnen geïnduceerd worden door middel van een radiozender B1 die korte maar krachtige radiofrequente pulsen met v = vL uitzendt. Voor supergeleidende magneten van 4,7 en 11,75 Tesla zijn de bijpassende resonantiefrequenties van protonen respectievelijk 200 en 500 MHz. Macroscopisch gezien zullen de afzonderlijke μ-vectoren zich statistisch verdelen over twee kegelhelften. Hierbij zijn de vectoren in de richting van B0 lichtjes in de meerderheid (n ↑ > n ↓). De vectoriële som van al deze kleine μvectoren resulteert in een netto Z-magnetisatie, georiënteerd volgens de Z-as en voorgesteld door de magnetisatievector M0. Deze vector heeft dezelfde richting en zin als vector B0. (zie figuur 5a).

5a

5b

Figuur 5. a Statistische verdeling van de μ-vectoren over twee kegelhelften. b Situatie na een 90° puls.

De hoek α die de vector M0 maakt tijdens de B1 puls is afhankelijk van de duur en de sterkte van de radiopuls B1. Bij een 90° puls (α=90°) komt de vector M0 in het X-Y vlak terecht. De Z-component wordt nu 0 waarentegen de Y-component een maximale waarde M0 bereikt (zie figuur 5b). Na een 90° puls is het aantal μ-vectoren gelijk verdeeld over de twee energietoestanden (zie figuur 6) en is MZ=0 en MY=M0.

13

E m= -1/2

90° puls

m= +1/2

m= -1/2 m= +1/2

Figuur 6. Bezetting van de energieniveaus na een 90° puls.

Bij een 180° puls is de Z-component maximaal negatief (-M0) waarentegen de Y component dan weer 0 is. Het is de X-Y magnetisatie die detecteerbaar is tijdens de detectiefase door een detector, opgesteld langs de Y-as.

2.2 Relaxatie Na verstoring van het evenwicht door de B1 zal de evenwichtssituatie zich herstellen door relaxatie. Men onderscheidt voornamelijk twee relaxatieprocessen: longitudinale relaxatie en transversale relaxatie.

2.2.1 Longitudinale relaxatie Deze relaxatie beschrijft het exponentieel heringroeien van de Z-component van de magnetisatie vector tijdens het herstel (zie figuur 7). Deze relaxatie wordt ook de spin-rooster relaxatie genoemd aangezien de opgeslagen energiequanta aan de omgeving, het rooster, worden afgegeven. Het proces kan beschreven worden als een exponentiële functie. De snelheid waarmee dit herstel gebeurt wordt uitgedrukt door middel van de T1 relaxatietijd.

Figuur 7. Longitudinale relaxatie. Na verloop van tijd wanneer de magnetisatie volledig gerelaxeerd is heeft de Z-component opnieuw zijn maximale waarde MZ=M0 bereikt.

14

bepaling van de T1 relaxatietijd: Inversion recovery experiment De pulssequentie, in dit experiment gebruikt, begint met een 180° puls die gevolgd wordt door een variabele wachttijd (τ) gedurende welke het systeem gedeeltelijk relaxeert. De ingroei na deze 180° puls kan mathematisch als volgt beschreven worden: M z = M 0 (1 − 2e −τ / T 1 )

Na de variabele wachttijd τ zorgt een 90° puls voor de detectie van het signaal door de magnetisatievector in het X-Y vlak te brengen. Het experiment wordt herhaald voor variabele τ-waarden. De pulssequentie kan als volgt beschreven worden: preparatietijd - 180° - τ - 90° - detectie Hierbij is de preparatietijd een wachttijd waardoor het hele systeem tot relaxatie kan komen. De wachttijd Td van een experiment is best 5 x T1. Hierdoor is men zeker dat het systeem volledig gerelaxeerd is alvorens met een nieuwe pulssequentie gestart wordt [20].

2.2.2 Transversale relaxatie Deze relaxatie beschrijft het exponentieel inkrimpen van de Y-as magnetisatie na een 90° puls (zie figuur 8). Na de verstoring van het evenwicht zal de MY-component immers afnemen. Deze vorm van relaxatie wordt de spin-spin relaxatie genoemd omdat de energiequanta uitgewisseld worden tussen naburige kernmagneetjes. Mathematisch kan deze relaxatie als volgt beschreven worden: M Y = M 0e−t / T 2

Hierin is T2 de tijd waarin de Y-component met een factor e afneemt. Deze relaxatie, de T2 relaxatie, verloopt efficiënter wanneer de kerndeeltjes minder beweeglijk zijn. T2 is altijd kleiner of gelijk aan T1.

Figuur 8. Transversale relaxatie. Na verloop van tijd, wanneer de magnetisatie volledig gerelaxeerd is heeft de Y-component opnieuw de waarde 0 bereikt.

15

bepaling van T2 relaxatietijd: Carr-Purcell-Meiboom-Gill (CPMG) experiment De pulssequentie in dit experiment begint met een 90° puls. Hierbij komt de vector M0 langs de Y-as te liggen. Door veldinhomogeniteiten op verschillende plaatsen in het sample en T2 relaxatie zal de magnetisatievector uitwaaieren. Het uitwaaieren als gevolg van veldinhomogeniteiten kan geneutraliseerd worden door het toedienen van een 180° puls na een wachttijd τ. De detectie van het echosignaal, enkel afgezwakt door T2 relaxatie, gebeurt na nog eens een wachttijd τ gewacht te hebben. De volledige sequentie ziet er als volgt uit: Preparatietijd-90° - (τ - 180° - τ)n – detectie Toename van het aantal ‘spin-echo’ cycli gaat gepaard met een verlenging van de variabele τ in de voorgaande formule [20].

2.3 Chemische shift Wanneer een atoom in een magnetisch veld gebracht wordt, zorgen de locale (isotrope) en naburige (anisotrope) electronenbewegingen voor kleine veranderingen in het door de kern aangevoelde magnetisch veld. Het effectief veld (Beff) zal dus verschillend zijn van B0. Beff = B0 (1 − σ )

Hierin is σ de dimensieloze magnetische afschermingsconstante. Daar Beff verschillend is voor verschillende electronenomgevingen zullen ook de resonantiefrequenties verschillend zijn. Dit resulteert in de zogenaamde chemische verschuiving of chemical shift. Meer precies is de chemische shift van een kern het genormeerde verschil tussen de resonatiefrequentie van de kern en een standaard. De chemische shift wordt weergeven in de grootheid ppm (parts per million). De chemische shift is dus meerbepaald een maat voor de chemische omgeving rond een kern.

2.4 J-koppeling Twee kernen met een verschillende chemische omgeving (niet-equivalente kernen) kunnen zorgen voor het fenomeen van de spin-spin koppeling of J-koppeling. Het mechanisme verloopt via de bindingselektronen (vandaar ook de naam scalaire kopppeling) en treedt meestal op voor protonen die door twee ( 2 J of geminale koppeling) of drie ( 3 J of vicinale koppeling) bindingen van elkaar gescheiden zijn. Het is dit fenomeen dat instaat voor het verschijnen van singuletten, doubletten, tripletten,... in het proton spectrum.

16

2.5 Uitzicht NMR spectrum NMR spectra worden doorgaans weergegeven in plots waarbij de signaalintensiteit uitgezet wordt in functie van de frequentie (ppm) (zie figuur 2). Door de integratiewaarde of piekhoogte

van

deze

resonantiepieken

te

berekenen

kan

informatie

betreffende

metabolietconcentraties bekomen worden. De oppervlakte of hoogte van elke piek wordt immers bepaald door de hoeveelheid waterstofkernen die met deze welbepaalde frequentie resoneren. Structurele informatie kan bekomen worden uit parameters, gemeten in NMR spectra, zoals de chemische shift ( δ in ppm), spin-spin koppelingspatronen, koppelingsconstanten (J in Hz) en signaal intensiteiten [21].

17

Hoofdstuk 3: Optimalisatie staalbereiding en NMR parameters 3.1 pH urine De normale fysiologische pH van urine varieert van 5 tot 8. De chemische verschuiving van meerdere metabolieten blijkt echter pH afhankelijk te zijn [6]. Uit figuur 9 blijkt inderdaad dat resonanties

van

bijvoorbeeld

histidine,

creatine,

creatinine

en

citraat

lichte

shiftverschuivingen ondergaan in functie van de pH.

8

ppm

4

3

3

4

5

6

7

pH

Figuur 9. Chemische shift in functie van pH. Resonanties van histidine (■), creatine en creatinine (▲), glycine (●) en citraat (○) werden bepaald in urinestalen die met 1M NaOH of 1M HCl naar verschillende pH waarden werden gebracht.

Om verschillen in chemische shift van resonanties tussen verschillende urinestalen uit te sluiten werd besloten om pH-verschillen tussen stalen onderling te beperken door toevoeging van fosfaatbuffer (0,2 M Na2HP04 / 0,04 M NaH2P04, pH 7,4 [17]). De capaciteit van deze buffer werd bepaald door een reeks urinestalen te maken in functie van de pH. Elk staal van deze reeks werd gebufferd in een urine/buffer verhouding van 1/3, 1/2 en 1/1. De pH van deze urine-buffer verhoudingen werd gemeten en uitgezet in een grafiek (zie figuur 10).

18

7,5

pH urine-buffer

7,4

7,3

7,2

7,1

7,0

4,5

5,0

5,5

6,0

6,5

7,0

7,5

8,0

8,5

pH urine

Figuur 10. Buffercapaciteit fosfaatbuffer. De pH waarden werden bepaald voor een reeks urinestalen, variërend in pH, die gebufferd werden in een urine/buffer verhouding van 1/3(▲), 1/2(■) en 1/1(○).

Uit figuur 10 blijkt enerzijds dat toevoeging van fosfaatbuffer in een urine/buffer verhouding van 1/3 ervoor zorgt dat de pH waarde het minst afwijkt van pH 7,4. De chemische shift van welbepaalde componenten is zeer pH gevoelig. Daarom werd geopteerd om de urine vooreerst op pH 7,4 te stellen met 1M NaOH of 1M HCl en deze nadien te bufferen door toevoeging van fosfaatbuffer in een urine/buffer verhouding van 1/1. Vermits de pH toch eerst op +/- 7,4 diende gebracht te worden, werd geopteerd voor de urine/buffer verhouding van 1/1 om zo het te lyofiliseren volume te beperken (zie ook 3.4.3)

3.2 Concentratie urinestalen Om de hoeveelheid water in de stalen, die de NMR spectroscopische analyses bemoeilijkt, te beperken, worden alle stalen gelyofiliseerd en opnieuw opgelost in het protonvrije oplosmiddel D2O. Het is mogelijk om via het oplossen van verschillende hoeveelheden lyofilisaat in D2O de concentratie aan urinaire metabolieten te verhogen of te verlagen. De bandbreedte op halve hoogte ( Δv 1 2 ) van het NMR-signaal is afhankelijk van de moleculaire beweeglijkheid (T2 relaxatietijd) zodat een te hoge metabolietconcentratie een negatief effect kan hebben op de resolutie. Daarom werd gezocht naar de metabolietconcentraties met de meest optimale resolutie en signaal-ruis verhouding. Lyofilisaten werden zo opgelost in D2O dat een verhouding urine/D2O van 2/1, 1/1 en 1/2 werd bekomen. Een gulden middenweg waarbij de beste signaal-ruis verhouding in combinatie met de beste resolutie werd bekomen bestond erin om de oorspronkelijke hoeveelheid metabolieten te behouden. Dit wil zeggen dat 19

alle lyofilisaten gebruikt in deze studie afkomstig zijn van oplossingen bestaande uit 1ml urine en 1 ml buffer en daarna voor NMR analyse werden heropgelost in 1ml D2O. Op deze wijze is het later ook eenvoudiger om bepaalde componenten eventueel correct te kwantificeren.

3.3 Staalvoorbereiding Samenvattend werden de urinestalen dus als volgt bereid: -De pH van urine werd door middel van 1M NaOH of 1M HCl naar pH +/- 7,4 gebracht waarna deze gebufferd werd door toevoeging van fosfaatbuffer (0,2 M Na2HP04 / 0,04 M NaH2P04, pH 7,4 en 4°C [17]) in een urine/buffer verhouding van 1/1. -De stalen werden na invriezen met vloeibare stikstof overnacht gelyofiliseerd. Na lyofilisatie werden de stalen ingevroren bij -80°C tot verdere verwerking. -De lyofilisaten werden nadien heropgelost in 1ml stockoplossing (interne standaard in D2O: zie 4.1.2) waarbij de oorspronkelijke concentratie urinaire metabolieten behouden bleef. Het geheel werd overgebracht in een 5mm NMR buisje en geanalyseerd met behulp van 1H NMR spectroscopie op een 400 MHz (9,4 Tesla) spectrometer.

3.4 Wegwerken brede basislijn Uit figuur 2 blijkt overduidelijk dat de basislijn van klassieke 1H-NMR spectra van urine een breed achtergrondsignaal vertoont. Dit is het meest uitgesproken in de regio van 3 tot 4 ppm. 1

H NMR spectra van serum of plasma stalen tonen tevens deze brede achtergrond die in dit

geval toegeschreven wordt aan proteïnen zoals onder andere albumine. Door de geringe mobiliteit in de oplossing hebben deze macromoleculen immers een korte T2 relaxatietijd [5, 22]. In fysiologisch normale urine wordt per dag echter maar tussen 50 en 150 mg proteïne aangetroffen (zie figuur 11) [23].

20

albumine IgG lichte ketens IgA overige componenten

Figuur 11. Samenstelling van proteïnen in normale humane urine [23].

Verondersteld wordt dat deze proteïnen in 1H-NMR spectra van humane urine ook voor de brede basislijn zorgen. Om dit te verifiëren werd getracht om de macromoleculen en grotere componenten uit de urinestalen te verwijderen door fysicochemische manipulaties.

3.4.1 Centrifugatie Via centrifugatie werd getracht om componenten zoals celmateriaal te verwijderen. Voor dit experiment werd een bereid urinestaal (gebufferd in een urine/buffer verhouding van 1/1) volgens een beschikbaar protocol [24] gecentrifugeerd met een Eppendorf centrifuge 5810. De vloeistof boven de pellet werd afgenomen en verder verwerkt zoals hiervoor beschreven (lyofiliseren en opnieuw oplossen in 1ml D2O) voor analyse.

3.4.2 Filtratie Via filtratie met filters met een cut-off van respectievelijk 5000 en 1000 Da zouden proteïnen zoals albumine (MW=69000 Da [25]) zeker uit de urinestalen moeten verdwijnen. Een bereid urinestaal werd gefiltreerd met behulp van ultrafree® MC PLLC centrifugal filters met een cut-off van 5000 Da. Stalen werden gedurende 40 minuten aan 12000 rpm gecentrifugeerd in een Eppendorf centrifuge 5415. Het filtraat werd onmiddelijk verwerkt zoals hierboven beschreven. Een tweede bereid urinestaal werd gefiltreerd door gebruik te maken van een macrosep® centrifugal device met een cut-off van 1000 Da. Het geheel werd gedurende 90 minuten

21

gecentrifugeerd met een eppendorf centrifuge 5810 zoals voorgeschreven. Het filtraat werd vervolgens verwerkt zoals hierboven aangehaald.

3.4.3 Ionensterkte en uitzouting Om na te gaan of de zouten, afkomstig uit de buffer, niet zorgen voor het brede achtergrondsignaal, ten gevolge van ionensterkte of uitzouting van eiwitten, werden stalen bereid met toenemende zoutconcentratie. Hiertoe werden oplossingen bereid met urine/buffer = 1/1, 1/2 en 1/3. Tijdens dit experiment werd geen associatie gevonden tussen concentratie bufferzouten en het brede achtergrondsignaal.

3.4.4 Zure hydrolyse Zure hydrolyse maakt het mogelijk om peptidebindingen tussen aminozuren in eiwitten te verbreken. Op deze manier worden proteïnen in kleinere fragmenten geknipt. Zuivere, onbereide urine werd aangezuurd met 6 N HCl tot een pH waarde van 1. Dit aangezuurd staal werd hierna gedurende 3 uur gekookt in een oliebad. Door het gebruik van een koeler werd voorkomen dat water uit de urine kon verdampen. Na afkoeling tot kamertemperatuur werd de gehydrolyseerde urine gebufferd en verder verwerkt zoals reeds eerder beschreven.

3.4.5 Fase scheiding Zoals boven beschreven werden de lyofilisaten steeds opnieuw opgelost in 1 ml D2O. Hierna werd, zoals later meer in detail beschreven, de oplossing overgebracht in een NMR-buisje voor 1H-NMR spectroscopische analyse. Er werd regelmatig fase-scheiding waargenomen: een meer troebele fase met daarbovenop een meer heldere fase. Om na te gaan of de troebele fase gecorreleerd was met het breed achtergrondsignaal werd de heldere bovenstaande fase afgenomen en terug aangelengd met D2O tot een volume van 1ml.

3.4.6 Protonuitwisseling met D2O Waterstofatomen in NH of OH groepen kunnen uitwisselen met andere protonen. Indien deze uitwisseling langzaam is op de NMR-tijdschaal kan dit tot merkbare bandverbreding leiden. Het wisselen van waterstof voor een deuterium atoom kan er misschien voor zorgen dat de achtergrondverbreding verdwijnt. Een zuiver urinestaal werd daarom 2x verdund met D2O en nadien gelyofiliseerd. Het lyofilisaat werd nogmaals 2x heropgelost in D20 en overnacht

22

gelyofiliseerd. Door bovengenoemde handeling uit te voeren werd getracht om zoveel mogelijk protonen uit te wisselen met deuterium atomen.

3.4.7 Resultaten en conclusie Geen van bovenstaande fysicochemische manipulaties lieten echter een merkbare verbetering van

het

breed

achtergrondsignaal

merken.

Dit

betekent

dat

de

achtergrond

hoogstwaarschijnlijk niet afkomstig is van eiwitten of andere macromoleculaire componenten. Om

trage

protonuitwisselingsprocessen

volledig

uit

te

schakelen

zou

het

protonuitwisselingsexperiment (zie 3.4.6) eventueel kunnen herhaald worden onder zuurkatalyse.

3.5 1H NMR Aangezien bovenbeschreven fysicochemische manipulaties geen verbetering in het brede achtergrondsignaal lieten merken werd besloten om het probleem van de brede basislijn te benaderen vanuit de 1H-NMR opname zelf. Verwarming tot 60°C van het staal tijdens de acquisitie toont geen verbetering van het brede achtergrondsignaal. Door te verwarmen werd gehoopt dat de mobiliteit van grotere componenten met een korte T2 relaxatietijd zou verhogen. Hierdoor wordt de T2 relaxatietijd immers verhoogd. Gebruik van een CarrPurcell-Meiboom-Gill (CPMG) pulssequentie (lichtjes T2 gewogen opname waardoor de componenten met korte T2 relaxatietijd weggerelaxeerd zijn) laat ook geen merkbare verbetering van het brede achtergrondsignaal merken. Gebruik van J-resolved 1H-NMR spectroscopie daarentegen zorgt wel voor duidelijke afname van de brede achtergrond (zie bijlage 1). Niettegenstaande op deze manier spectra bekomen worden die vrij zijn van achtergrond, blijft het ten gronde verklaren moeilijk omdat de origine van de bandverbreding onduidelijk blijft.

23

Hoofdstuk 4: Opsporen ziektemerkers 4.1 Materiaal en methoden 4.1.1 Staalname Urine ratten Twee vrouwelijke Lewis ratten van 8 weken oud werden geïmmuniseerd met MBP volgens een reeds vooraf gepubliceerd immunisatieprotocol [26, 27]. Kortweg beschreven werden de dieren

eerst

verlamd

door

intra-peritoneale

toediening

van

75

μl

nembutal

(natriumpentobarbital, CEVA sante animale) per 100 gram lichaamsgewicht. Nadien werd per rat 200 μl MBP-mix (10% MBP, 12,5% microbacterium, 17,5% PBS, 60% CFA) subcutaan toegediend, verspreid over de twee voetzolen. Vanaf het punt van immunisatie werden de ratten dagelijks gewogen. Tijdens het ziekteverloop werden de ratten klinisch gescoord. Afhankelijk van hun ziektetoestand werden volgende scores toegekend: gezond = 0, staartverlamming = 1, achterpootverlamming = 2-3, volledige verlamming = 4. De ratten werden op welbepaalde tijdstippen (zie figuur 12) in een metabole kooi geplaatst. Dit type kooi laat toe om urine te verzamelen, gescheiden van eventuele faeces. De urine werd opgevangen in een ijs-gekoeld reservoir, dit om bacteriegroei in de urine tegen te gaan. Er werd geopteerd om de ratten ’s nachts in de metabole kooi te plaatsen aangezien deze dieren vooral ’s nachts actief zijn en dan beduidend meer urineren in vergelijking met overdag. Na verzamelen werd de urine onmiddelijk gebufferd en verder verwerkt zoals reeds eerder beschreven.

24

A

B

C

D

E

G

F

H

4

klinische score

3

2

1

0 -5

5

10

15

20

dag na immunisatie Figuur 12. Staalname urine EAE ratten. ♀ Lewis ratten werden op tijdstip 0 geïmmuniseerd met MBP ter inducering van EAE. Op welbepaalde tijdstippen werden de ratten in een metabole kooi geplaatst waardoor collectie van urine (AÆH) kon gebeuren. ○ = score rat 1, ● = score rat 2. Verticale volle lijn: afnamepunt urine rat 2, verticale gepunte lijn: afnamepunt urine rat 1 en 2, verticale half-volle lijn: afnamepunt rat 1.

Urine van humane controle patiënten Aan 5 mannelijke vrijwilligers met een gemiddelde leeftijd van 21 jaar werd gevraagd om 3 dagen in de week een willekeurig urinestaal af te nemen. Deze personen vertoonden geen symptomen van multiple sclerose. De urine van deze personen werd onmiddellijk naar een pH waarde van 7,4 gebracht door toevoeging van 1M NaOH of 1M HCl en gebufferd. Deze bereide stalen werden uitverdeeld in volumes van 1ml, ingevroren met vloeibare stikstof en bewaard bij -80° tot verdere verwerking. Van elke persoon werd vervolgens een urinepool gemaakt door van elke afname 1 ml te ontdooien en samen te voegen. Dit poolen werd gedaan om dag-tot-dag variatie in urinaire componenten uit te middelen. De pool van elke persoon werd opnieuw ingevroren met vloeibare stikstof, gelyofiliseerd en verder verwerkt zoals reeds eerder beschreven.

Urine van MS patiënten Aan 8 patiënten waar de diagnose van MS werd gesteld werd gevraagd om gedurende één week een aantal urinestalen af te nemen. De patiënten vertoonden variabele symptomen varierend van lichte tot zeer ernstige symptomen. Van 3 patiënten werden 2 afnames gedaan.

25

Voor de andere 5 patiënten werden 3 afnames genoteerd. De stalen werden op dezelfde manier verwerkt als beschreven bij de gezonde controle urinestalen.

4.1.2 Stockoplossing van interne referentie in D2O Zoals reeds eerder vermeld werden gelyofiliseerde stalen heropgelost in 1ml D2O met hieraan een interne standaard toegevoegd. Om alle stalen te voorzien van exact dezelfde concentratie aan

interne

referentie,

werd

voldoende

stockoplossing

3-trimethylsilyl-2,2,3,3-

tetradeuteropropionaat (TSP, Cambridge Isotope Laboratories, Inc.) aangemaakt met een concentratie van 0,0058 M. Het NMR signaal van deze standaard werd tevens op 0 ppm gezet.

4.1.3 1H NMR De 1H-NMR spectra werden opgenomen in een 5 mm NMR buisje op een 400 MHz Varian Inova spectrometer (9,4 Tesla) uitgerust met een moderne proton probe. De temperatuur werd constant gehouden op 23°C. Spectra werden opgenomen met een spectraal bereik (sw) van 4 kHz, een pulslengte (pw) van 6 μs, acquisitietijd (at) van 5 s, 120 accumulaties en een filterband (fb) van 4 kHz. Een preparatietijd van 12,5 s werd gerespecteerd tussen opeenvolgende accumulaties. Het resterende protonsignaal van in D2O (99,5 % gedeutereerd) aanwezig H2O en HOD werd onderdrukt door selectieve homonucleaire protonontkoppeling. Hiertoe werd tijdens de preparatieperiode met de decoupler selectief (met laag vermogen) ingestraald op dit signaal.

4.1.4 Spectrale analyse Aangezien de complexiteit van deze spectra groot is, werd geopteerd om verschillen in urinaire metabolieten tussen zieke individuen en gezonde controles via twee verschillende invalshoeken op te sporen. Een eerste manier bestond erin om de signalen afkomstig van NAA, glutamine, glutamaat, choline, inositol en neopterine altijd op te nemen in de datamatrix. De chemische shiften van deze componenten zijn reeds beschreven in de literatuur. Een tweede manier bestond erin om actief op zoek te gaan naar verhoogde of verlaagde metabolietsignalen. De methodologie wordt hieronder beschreven:

26

Humane urines In de verschillende spectra werd eerst het signaal van de interne TSP standaard (0 ppm) op dezelfde verticale hoogte gezet. Vervolgens werden de piekhoogtes van alle signalen gestockeerd in een ascii file. Een volgende stap bestond erin om van elk spectrum de totale integraalwaarde te berekenen, exclusief resterend water en de TSP piek. Deze integralen werden uitgedrukt ten opzichte van een constante integraalwaarde voor de TSP piek. Om te corrigeren voor concentratieverschillen tussen de urinestalen onderling werd geopteerd om alle piekhoogtes, vervat in de ascii file exlusief de TSP piek, te delen door deze integraalwaarde. Vervolgens werd een gemiddeld controle spectrum gecreëerd van de 5 controle spectra door van elke piekhoogte het gemiddelde te berekenen (zie bijlage 2). Dit gemiddeld spectrum werd vervolgens van de 8 spectra van de MS patiënten gemiddeld afgetrokken. Signalen die in intensiteit verschillen tussen MS patiënten en het gemiddeld controle spectrum kunnen op deze wijze visueel eenvoudig gekarakteriseerd worden (zie bijlage 3). Uit deze verschilspectra werden enkel de pieken geselecteerd waarvan de intensiteit 10x hoger of lager was dan de achtergrondruis. Vervolgens werden enkel signalen geselecteerd die in minimum 3 verschil-spectra verschil vertoonden. Een volgende stap bestond erin om de piekintensiteiten van de geselecteerde signalen te meten in de oorspronkelijke spectra (TSP op éénzelfde hoogte) van de MS patiënten en de gezonde controles. Als laatste stap werden deze piekintensiteiten gecorrigeerd voor concentratieverschillen aan de hand van hoger vermelde integratiewaarden. Voor de 5 controles werd vervolgens het gemiddelde en de standaarddeviatie bepaald. Voor de MS patiënten werden de intensiteiten uitgezet in plots die aangeven of de intensiteiten buiten een intensiteitsinterval vallen, bepaald door het gemiddelde ± 2x de standaarddeviatie van de pieken van de gezonde controles. Eventuele MS merkers zouden op deze wijze aangetoond kunnen worden.

Rat urines Op de wijze zoals hierboven reeds beschreven werden de twee spectra bekomen van urine voor immunisatie (rat 1 en rat 2) verwerkt tot een gemiddeld controle spectrum. Dit gemiddeld spectrum werd afgetrokken van de spectra bekomen uit urine op top van de ziekte (zie Figuur 12, F). Verschillen in intensiteit tussen gezonde ratten en ratten, op top van de ziekte, kunnen op deze manier eenvoudig gevisualiseerd worden. Enkel signalen die bij beide ratten afwijkend waren ten opzichte van het controlespectrum werden verder behandeld. Een 27

volgende stap bestond erin om de piekintensiteiten van deze gebieden nader te bepalen in de oorspronkelijke

spectra

(TSP

op

éénzelfde

verticale

waarde

en

correctie

voor

concentratieverschillen) voor alle urine afnames (zie figuur 12, A-H). De intensiteiten van de geselecteerde pieken werden uitgezet in grafieken die aangegeven of de intensiteiten buiten het controle-interval (gemiddelde ± 2x standaarddeviatie) vallen. Deze manier van voorstellen stelt ons in staat om na te gaan welke pieken veranderen in functie van de tijd. Eventuele merkers voor het ziekteverloop kunnen op deze manier opgemerkt worden.

4.2 Resultaten 4.2.1 Chemische shift van metabolieten in urine Ofschoon klassieke 1H NMR opnames van humane urine en urine van ratten (zie bijlage 4) vrij complex van aard zijn, is het toch mogelijk om via reeds bekende chemische shiften pieken toe te wijzen aan welbepaalde metabolieten (zie bijlage 5).

4.2.2 Ziektemerkers in urine Zoals reeds eerder beschreven, werd geopteerd om verschillen in urinaire metabolieten tussen zieke individuen en gezonde controles via twee verschillende invalshoeken op te sporen. Een eerste manier bestond erin om de signalen afkomstig van de merkers NAA, glutamine, glutamaat, choline, inositol en neopterine altijd op te nemen in de datamatrix. Een tweede manier bestond erin om actief op zoek te gaan naar verhoogde of verlaagde metabolietsignalen.

28

4.2.2.1 Merkers in urine van ratten Voor glutamaat/glutamine (glt/gln) werden in functie van het ziekteverloop verlaagde piekintensiteiten gevonden op posities 2,39 ppm en 3,77 ppm (zie figuur 13). De daling bereikt voor rat 2 een minimum op dag 14, waar het dier volop klinische symptomen van EAE vertoonden (zie figuur 12), om dan nadien terug te stijgen, ongeveer gelijklopend met het herstel van het dier. Het glutamaat signaal op positie 2,05 ppm, dat samenvalt met een NAA signaal, vertoonde tevens een dalende trend in functie van het ziekteverloop (figuur niet weergegeven). 0,024

Controle (con) rat1 rat2

0,022 0,020

Piekhoogte (a.u.)

0,018

... 2x stdev controle (con) 3.77 ppm

0,016 0,014 0,012 0,010 0,008 0,006 0,004 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

Figuur 13. Glutamaat/glutamine op 3,77 ppm.

De creatine/creatinine (cr/cn) piek op 3,05 ppm kent na immunisatie initieel een stijgend en nadien een dalend verloop met een top op dag 14. De stijging van deze piek, op top van de ziekte, kan verklaard worden door een verhoogde hoeveelheid creatine in de urine van ratten, aangezien de creatinepiek op 3,94 ppm een gelijkend patroon vertoont en de creatininepiek op 4,06 ppm vrij stabiel blijft binnen de grenzen van de controle waarden (zie figuur 14).

29

con rat1 rat2

0,09 0,08

... 2x stdev con 3.05 ppm

0,06 0,05 0,04 0,03 0,02

... 2x stdev con 3.94 ppm

0,04

Piekhoogte (a.u.)

piekhoogte (a.u.)

0,07

con rat1 rat2

0,05

0,03

0,02

0,01

0,00

0,01 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

-8 -7

20

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

Dag na immunisatie (dagen)

B

A 0,012 0,015

0,010

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

0,010

con rat1 rat2

0,005

0,000

... 2x stdev con 4,06 ppm

-0,005 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

20

0,008

con rat1 rat2

0,006

... 2x stdev con 3.23 ppm

0,004

0,002

0,000 -8 -7

4

Dag na immunisatie (dagen)

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

D

C

Figuur 14. Piek creatine/creatinine op 3,05 ppm (A), piek creatine + choline op 3,94 ppm (B), piek creatinine op 4,06 ppm (C) en piek choline op 3,23 ppm (D).

De intensiteit van de creatinepiek op 3,94 ppm blijkt echter sterker gestegen te zijn ten opzichte van de controle dan de creatinepiek op 3,05 ppm. Dit kan verklaard worden door een stijging van choline dat eveneens op 3,94 ppm een signaal heeft. De piek van choline op 3,23 ppm is tevens verhoogd en vertoont een sterk gelijk patroon met een maximum voor rat 2 op dag 16 na immunisatie wanneer klinische symptomen van EAE duidelijk zichtbaar zijn (zie figuur 14).

30

4.2.2.2 Geselecteerde pieken op basis van verschilspectra ratten De pieken van phenylacetylglycine op positie 3,68 ppm en 3,76 ppm vertonen beide hetzelfde dalende patroon met de laagste intensiteiten op dag 12 en 14 na immunisatie (zie figuur 15). 0,009

0,007

0,008

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

0,006

0,005

0,004

con rat1 rat2

0,003

0,002

... 2x stdev con 3,68 ppm

0,007 0,006 0,005

con rat1 rat2

0,004 0,003

... 2x stdev con 3,76 ppm

0,002 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

Dag na immunisatie (dagen)

A

18

20

-8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

B

Figuur 15. Phenylacetylglycine op 3,68 ppm (A) en 3,76 ppm (B).

31

De twee tripletten van α-ketoglutaraat op posities 2,46 ppm en 3,00 ppm vertonen een dalende trend met de laagste intensiteiten tussen 12 en 14 dagen na immunisatie (zie figuur16). Op dag 20, wanneer de ratten klinisch hersteld lijken, vallen de piekintensiteiten nog steeds buiten het normale concentratie interval. 0,014

0,010

0,012

Piekhoogte (a.u.)

0,006

con rat1 rat2

0,004

0,002

... 2x stdev con 2,46 ppm

0,010

con rat1 rat2

0,008

... 2x stdev con 3.00 ppm

0,006 0,004 0,002 0,000

0,000 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

-8 -7

20

4

6

8

10

12

14

16

18

Dag na immunisatie (dagen)

Dag na immunisatie (dagen)

B

A Figuur 16. α-ketoglutaraat op 2,46 ppm (A) en 3,00 ppm (B).

Het doublet op 0,95 ppm, dat toe te schrijven kan zijn aan zowel leucine als valine, vertoont een dalend patroon met de meest uitgesproken daling wanneer beide ratten volop symptomen van EAE vertonen. Wanneer beide ratten dan weer herstellen, keert de intensiteit van dit doublet weer naar quasi de normale waarden (zie figuur 17a). Dimethylamine op 2,73 ppm vertoont een gelijkaardig patroon waarbij beide ratten een minimum vertonen op het tijdstip dat ze symptomen van EAE vertonen (zie figuur 17b). 0,0030

0,014

0,0025

0,012

0,0020

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

0,008

0,0015

con rat1 rat2

0,0010

0,0005

... 2x stdev con 0,95 ppm

0,010

0,008

con rat1 rat2

0,006

0,004

... 2x stdev con 2,73 ppm

0,0000 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

Figuur 17a. Doublet van valine en/of leucine op 0,95

-8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

20

Dag na immunisatie (dagen)

Figuur 17b. Dimethylamine op 2,73 ppm.

ppm.

32

20

Ook het singulet op 3,57 ppm van glycine lijkt te dalen na immunisatie (zie figuur 18a). Een duidelijke tendens valt ook te bespeuren voor de pieken van citraat, waarvan deze op 2,7 ppm weergegeven is in figuur 18b. Hier vertonen beide ratten ook een maximale daling van citraat op het tijdstip dat ze maximaal ziek zijn. Na herstel keren de intensiteiten terug naar waardes die zelfs lichtjes hoger liggen dan voor de controle. con rat1 rat2

0,011

0,016 0,014

0,010

... 2x stdev con 3,57 ppm

0,012

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

0,009 0,008 0,007 0,006 0,005

con rat1 rat2

0,010 0,008

... 2x stdev con 2,7 ppm

0,006 0,004

0,004

0,002

0,003

0,000

0,002 -8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

Dagen na immunisatie (dagen)

Figuur 18a. Glycine op 3,57 ppm.

20

-8 -7

4

6

8

10

12

14

16

18

Dag na immunisatie (dagen)

Figuur 18b. Citraat op 2,7 ppm.

33

20

4.2.2.3 Merkers in humane urine Op enkele uitzonderingen na vertonen de pieken voor glutamaat op 2,05 ppm en glutamine op 2,39 ppm geen merkbare verandering in vergelijking met de controles. Dit wordt nogmaals bevestigd door de glutamaat/glutamine piek op 3,76 ppm (zie figuur 19). 0,012

0,005

con Patiënten

0,008

0,004

... 2x stdev con 2,05 ppm

Piekhoogte (a.u.)

Piekhoogte (a.u.)

0,010

0,006 0,004

con Patiënten

0,003

... 2x stdev con 2,39 ppm

0,002

0,001

0,002

0,000

0,000 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

CON

pat8

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

B

A con Patiënten

0,030

... 2x stdev con 3,76 ppm

0,025

Piekhoogte (a.u.)

0,020 0,015 0,010

Figuur 19. Glutamaat op 2,05 ppm (A), glutamine op

0,005

2,39 ppm (B) en glutamaat/glutamine op 3,76 ppm (C).

0,000 -0,005 -0,010 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

C

34

De creatine/creatinine piek op 3,05 ppm blijkt bij MS patiënten systematisch verlaagd te zijn ten opzichte van de controle. De daling in intensiteit van deze piek valt te verklaren door een verlaagde hoeveelheid creatinine in urine van MS patiënten, aangezien de creatininepiek op 4,06 ppm hetzelfde gedrag vertoont (zie figuur 20). De hoeveelheid creatine blijkt bij enkel bij 3 patiënten verhoogd te zijn daar de intensiteit van de creatine piek op 3,94 voor deze patiënten hoger lag dan bij de controle (zie figuur 20). con Patiënten

0,40

0,035 0,030

... 2x stdev con 3,05 ppm

0,30

Piekhoogte (a.u.)

0,025

Piekhoogte (a.u.)

0,35

0,25 0,20

con Patiënten

0,020 0,015

... 2x stdev con 3,94 ppm

0,010 0,005

0,15

0,000 0,10 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

0,05 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

A

B con Patiënten

0,2

Piekhoogte (a.u.)

... 2x stdev con 4,06 ppm

Figuur 20. Creatine/creatinine op 3,05 ppm (A), creatine op 3,94

0,1

ppm (B) en creatinine op 4,06 ppm (C).

0,0 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

C

35

De piek op 3,36 ppm, toe te schrijven aan inositol, is bij de MS patiënten duidelijk afwijkend van deze van gezonde personen. Een duidelijk verhoogde of verlaagde trend valt echter niet te bespeuren (zie figuur 21). con Patiënten 0,010

... 2x stdev con 3,36 ppm

Piekhoogte (a.u.)

0,008

0,006

0,004

0,002

CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

Figuur 21. Inositol op 3,36 ppm.

4.2.2.4 Geselecteerde pieken op basis van humane verschilspectra Een piek op 1,35 ppm, waarvan de herkomst voorlopig nog onbekend is, toont voor het merendeel zeer duidelijk verlaagde waarden in vergelijking met de controles (zie figuur 22). con Patiënten

0,0055

... 2x stdev con 1,35 ppm

0,0050

Piekhoogte (a.u.)

0,0045 0,0040 0,0035 0,0030 0,0025 0,0020 0,0015 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

Figuur 22. Onbekende piek op 1,35 ppm.

36

De citraatpiek op 2,7 ppm vertoont bij de MS-patiënten, in vergelijking met de controlestalen, een duidelijke verandering. Een duidelijke verhoogde of verlaagde trend valt echter niet te bespeuren (zie figuur 23). con Patiënten 0,025

... 2x stdev con 2,7 ppm

Piekhoogte (a.u.)

0,020

0,015

0,010

0,005

0,000 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

Figuur 23. Citraat op 2,7 ppm.

De piek van dimethylamine op 2,73 ppm blijft met uitzondering van patiënt 1 binnen het normale controle-interval (zie figuur 24). con Patiënten

0,06

... 2x stdev con 2,73 ppm

Piekhoogte (a.u.)

0,05

0,04

0,03

0,02

0,01 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

--

Figuur 24. Dimethylamine op 2,73 ppm.

37

Het doublet op 0,95 ppm dat toe te schrijven kan zijn aan zowel leucine als valine blijkt in vergelijking met gezonde personen dikwijls verhoogd te zijn bij de MS patiënten (zie figuur 25). 0,0035 0,0030

con Patiënten

Piekhoogte (a.u.)

0,0025 0,0020

... 2x stdev con 0,95 ppm

0,0015 0,0010 0,0005 0,0000 CON

pat1

pat2

pat3

pat4

pat5

pat6

pat7

pat8

Figuur 25. Leucine en valine op 0,95 ppm.

38

4.3 Discussie en toekomstperspectieven Zoals reeds eerder in dit werk beschreven, is urine een interessante bron voor het opsporen van ziektemerkers. Met behulp van kwantitatieve 1H-NMR spectroscopie is het mogelijk om concentraties van metabolieten in vloeistoffen te bepalen. Deze techniek is dus uiterst geschikt voor het opsporen van deze ziektemerkers in urine. Waar in dit onderzoek gebleken is dat bepaalde componenten weinig variëren zijn er toch metabolieten gevonden die wel blijken te verschillen tussen gezonde en zieke individuen. In dit werk werden enkele metabolieten beschreven die in functie van het ziekteverloop in EAE ratten veranderingen ondergaan. In dit rattenmodel is het mogelijk om variatie betreffende geslacht, ouderdom, voeding, levensstijl, medicatie, tijd van staalname,... beperkt te houden. Standardisatie van deze variabelen is belangrijk wanneer eventuele merkers geëvalueerd worden. Niet tegenstaande bij deze dieren de meeste metabolietconcentraties terugkeren naar een normale waarde bij klinisch herstel (dag 20), zijn er toch enkele metabolieten waarvoor dit, op basis van deze preliminaire gegevens, niet lijkt op te gaan. In deze verkennende studie blijken er duidelijk verschillen in metabolietconcentraties te bestaan tussen urinestalen van gezonde personen en zieke individuen. Deze verschillen bieden opportuniteiten als diagnosemerkers en kunnen mogelijk ook bijdragen aan het ontrafelen van het ziektemechanisme bij MS. Het bevestigen van deze potentiële merkers aan de hand van een grotere datamatrix lijkt daarom zeker opportuun. Zoals in het begin van dit werk reeds aangehaald werd, staat het gebruik van de creatine/creatinine piek op 3,05 ppm als interne referentie ter discussie. Door toevoeging van de interne standaard (TSP) is het mogelijk om het gebruik van deze creatine/creatinine piek als interne referentie kritisch te evalueren. Uit figuur 20A blijkt duidelijk dat de intensiteit van deze piek bij MS patiënten tot drie keer lager kan liggen in vergelijking met gezonde personen. Het gebruik van deze piek als referentie dient dus met de nodige omzichtigheid te gebeuren. In dit werk werd een procedure op punt gesteld die toelaat om zonder gebruik te maken van de creatine/creatinine piek op 3,05 ppm systematisch metabolieten in urinestalen van EAE ratten en MS patiënten te bestuderen. In de huidige dataset werden duidelijke verschillen gevonden voor glutamaat en glutamine (daling) in urine van ratten en inositol (variabel) in humane urine ten opzichte van de

39

controle. Voor NAA en neopterine werd, ten opzichte van de controles, noch voor humaan en noch voor ratten een merkbaar verschil gevonden in de urine. Voor alle MS patiënten werd een beduidende daling van de concentratie aan creatinine waargenomen. Dit is in tegenstelling met de hoeveelheid creatine, die met uitzondering van 3 MS patiënten waarvoor een sterke verhoging waargenomen werd, een normale waarde vertoont (zie figuur 20). Op het toppunt van de ziekte vertoonde urine van EAE ratten in vergelijking met de controle een verhoogde hoeveelheid creatine. Niet tegenstaande de waarden van creatinine binnen het controle-interval vallen, lijkt toch een verhoging ten opzichte van de controles aanwezig te zijn. Dit zou geverifieerd moeten worden door het gebruik van een grotere populatie controles (zie figuur 14). Het blijft echter de vraag of creatine en creatinine geschikt zouden zijn als secundaire merkers voor de vroegtijdige diagnose van MS. Creatine wordt in de lever gesynthetiseerd en via de bloedbaan naar de spieren getransporteerd. Hier speelt gefosforyleerde creatine een cruciale rol in de energiehuishouding. Fosfocreatine wordt immers omgezet naar creatine waarbij de vrijgekomen fosfaatgroep gedoneerd wordt aan ADP zodat er bij een intense inspanning initieel voldoende ATP beschikbaar is. In de spieren wordt de fosfocreatine niet enzymatisch omgezet in creatinine en aan een constante rate vrijgezet in de bloedbaan. Hierdoor wordt creatinine gezien als een maat voor spiermassa. Creatinine wordt door de nieren geëxcreteerd via de urine. Hierdoor varieert de urinaire creatinine tussen personen met een verschillende spiermassa. Mannen excreteren bijvoorbeeld meer creatinine dan vrouwen [28]. Gezien de link van creatinine met de hoeveelheid spiermassa en het relatief eenvoudig kunnen kwantificeren ervan in urine met behulp van 1H NMR, kan deze methode eventueel aangewend worden bij het evalueren van fysiotherapie. Een reeds eerder aangehaald voordeel van deze techniek is dat urine zeer eenvoudig te verkrijgen is. In dit werk zijn er sterke aanwijzingen voor een verhoogde hoeveelheid choline in urine van EAE ratten (zie figuur 14D) . Eerder werd reeds een verhoogde hoeveelheid hiervan gevonden in urine van EAE apen [17]. Van choline is geweten dat het een functie heeft bij het behoud van de membraanintegriteit. In klinisch gelocaliseerde in vivo spectroscopie van de hersenen wordt een verhoogde hoeveelheid choline beschouwd als een merker voor verhoogde membraanombouw ten gevolge van demyelinisatie, remyelinisatie en ontsteking 40

[10, 29]. Aldus is het misschien mogelijk om via urinaire cholinebepaling inflammatie in de hersenen na te gaan. Ook werden in dit werk argumenten aangehaald voor een verhoogde hoeveelheid valine en/of leucine in urine van MS patiënten (zie figuur 25). In de literatuur was hiervan reeds een stijging beschreven in urine van ratten met een inflammatoire aandoening [7]. Specifiek voor de urine van EAE ratten wordt op de top van de ziekte een verlaging van Phenylacetylglycine, α-ketoglutaraat, dimethylamine en citraat vastgesteld. Specifiek voor humane urine werd een verlaging vastgesteld voor een tot nog toe onbekend signaal op 1,35 ppm.

5. Conclusie In dit werk werd in het kader van MS een methode geoptimaliseerd voor 1H-NMR spectroscopisch onderzoek van urine en aangewend om via systematische data-analyse, ziektemerkers te identificeren. Deze kunnen potentieel bijdragen aan het vroegtijdig opsporen van MS of helpen bij de ontrafeling van de MS pathologie. In deze studie werd gebruik gemaakt van het acuut EAE ratmodel en werden tevens urines van MS patiënten vergeleken met deze van gezonde controles. Er werd voor meerdere metabolieten een duidelijk verschil gevonden tussen zieke en gezonde individuen (creatine, creatinine,...). Via het gebruik van een grotere datamatrix dienen deze verschillen bevestigd te worden zodat dan later met behulp van de biochemische achtergrond van deze componenten het mechanisme van MS eventueel ontrafeld kan worden. Metabolieten die gekoppeld zijn aan de ziektetoestand van de MS patiënt (relapsing/remitting) kunnen opgespoord worden door van patiënten meerdere stalen in functie van de tijd af te nemen.

41

Referenties

1.

Isselbacher K, Braunwald E., Wilson J, Martin JB, Fauci AS, Kasper DL. Multiple Sclerosis and other demyelinating diseases: IN: Harrisons’s Principles of internal medicine. New York: Mc Graw Hill. 1994: p. 2287-2294.

2.

Sospedra M, Muraro R. Immunology of multiple sclerosis. Annu Rev Immunol, 2005. 23: p. 683-747.

3.

Neuhaus O, Stuve O, Archelos JJ, Hartung HP. Putative mechanisms of action of statins in multiple sclerosis--comparison to interferon-beta and glatiramer acetate. J Neurol Sci, 2005 233(1-2): p. 173-7.

4.

Swanborg RH. Experimental autoimmune encephalomyelitis in the rat: lessons in Tcell immunology and autoreactivity. Immunol Rev, 2001 184: p. 129-35.

5.

Lenz EM, Bright J. Wilson ID, Morgan SR, Nash AF, A 1H NMR-based metabonomic study of urine and plasma samples obtained from healthy human subjects. J Pharm Biomed Anal, 2003. 33(5): p. 1103-15.

6.

Lindon JC, Nicholson J. Holmes E, Everett JR, Metabonomics: Metabolic Processes Studied by NMR Spectroscopy of Biofluids. Concepts in Magnetic Resonance. 2000. 12(5): p. 289-320.

7.

Griffin JL, Anthony D, Campbell SJ, Gauldie J, Pitossi F, Styles P, Sibson NR, Study of cytokine induced neuropathology by high resolution proton NMR spectroscopy of rat urine. FEBS Lett, 2004. 568(1-3): p. 49-54.

8.

Barker PB. Fundamentals of clinical MRS: IN: Weekend Educational Courses: MR spectroscopy. Honolulu: International Society for Magnetic Resonance in Medicine. 2002. p. 168-170.

9.

Sarchielli P, Presciutti O., Pelliccioli GP, Tarducci R, Gobbi G, Chiarini P, Alberti A, Vicinanza F, Gallai V. Absolute quantification of brain metabolites by proton magnetic resonance spectroscopy in normal-appearing white matter of multiple sclerosis patients. Brain, 1999. 122 ( Pt 3): p. 513-21.

10.

De Stefano N, Bartolozzi M, Guidi L, Stromillo ML, Federico A, Magnetic resonance spectroscopy as a measure of brain damage in multiple sclerosis. J Neurol Sci, 2005. 233(1-2): p. 203-8. 42

11.

Teunissen CE, D.C., Polman C, Biological markers in CSF and blood for axonal degeneration in multiple sclerosis. Lancet Neurol, 2005. 4(1): p. 32-41.

12.

De Stefano N, M.P., Fu L, Narayanan S, Stanley J, Francis GS, Antel JP, Arnold DL, Axonal damage correlates with disability in patients with relapsing-remitting multiple sclerosis. Results of a longitudinal magnetic resonance spectroscopy study. Brain, 1998. 121 ( Pt 8): p. 1469-77.

13.

van der Maazen RW, V.I., Kleiboer BJ, van der Kogel AJ, Repopulation of O-2A progenitor cells after irradiation of the adult rat optic nerve analyzed by an in vitro clonogenic assay. Radiat Res, 1992. 132(1): p. 82-6.

14.

Bjartmar C, K.G., Mork S, Rudick R, Trapp BD, Neurological disability correlates with spinal cord axonal loss and reduced N-acetyl aspartate in chronic multiple sclerosis patients. Ann Neurol, 2000. 48(6): p. 893-901.

15.

Srinivasan R, S.N., Hurd R, Nelson S, Pelletier D. , Evidence of elevated glutamate in multiple sclerosis using magnetic resonance spectroscopy at 3 T. Brain, 2005. 128(Pt 5): p. 1016-25.

16.

TL, R., Proton MR spectroscopy in multiple sclerosis: value in establishing diagnosis, monitoring progression, and evaluating therapy. AJR Am J Roentgenol, 1991. 157(5): p. 1073-8.

17.

't Hart BA, V.J., Spijksma G, Brok HP, Polman C, van der Greef J, 1H-NMR spectroscopy combined with pattern recognition analysis reveals characteristic chemical patterns in urines of MS patients and non-human primates with MS-like disease. J Neurol Sci, 2003. 212(1-2): p. 21-30.

18.

Simone IL, T.C., Federico F, Liguori M, Lucivero V, Giannini P, Carrara D, Bellacosa A, Livrea P, Axonal damage in multiple sclerosis plaques: a combined magnetic resonance imaging and 1H-magnetic resonance spectroscopy study. J Neurol Sci, 2001. 182(2): p. 143-50.

19.

Ramin SL, T.W., Spotti AR, Proton magnetic resonance spectroscopy: clinical applications in patients with brain lesions. Sao Paulo Med J, 2003. 121(6): p. 254-9.

20.

PF, F., Phenomenology and Experimental considerations: IN: NMR relaxation. 2002.

21.

TW, F., Metabolite profiling by one- and two-dimensional NMR analysis of complex mixtures. Prog. NMR spectrosc, 1996. 28(2): p. 161-219.

22.

Lindon JC, N.J., Holmes E, Antti H, Bollard ME, Keun H, Beckonert O, Ebbels TM, Reily MD, Robertson D, Stevens GJ, Luke P, Breau AP, Cantor GH, Bible RH, Niederhauser U, Senn H, Schlotterbeck G, Sidelmann UG, Laursen SM, Tymiak A, 43

Car BD, Lehman-McKeeman L, Colet JM, Loukaci A, Thomas C, Contemporary issues in toxicology the role of metabonomics in toxicology and its evaluation by the COMET project. Toxicol Appl Pharmacol, 2003. 187(3): p. 137-46. 23.

Dorhout Mees EJ, R.J., Boer P, Oei HY, Simatupang TA, Observations on edema formation in the nephrotic syndrome in adults with minimal lesions. Am J Med, 1979. 67: p. 378-384.

24.

http://www.vysis.com/UrineSampleProcessing_30548.asp

25.

Boldt J, S.S., Plasma substitutes Minerva Anestesiol. Minerva Anestesiol, 2005. 71(12): p. 741-58.

26.

Vandenbark AA, G.T., Offner H., A myelin basic protein-specific T lymphocyte line that mediates experimental autoimmune encephalomyelitis. J Immunol, 1985. 135(1): p. 223-8.

27.

Ben-Nun A, W.H., Cohen IR, The rapid isolation of clonable antigen-specific T lymphocyte lines capable of mediating autoimmune encephalomyelitis. Eur J Immunol, 1981. 11(3): p. 195-9.

28.

Stead LM, B.J., Brosnan ME, Vance DE, Jacobs RL, Is it time to reevaluate methyl balance in humans? Am J Clin Nutr, 2006. 83(1): p. 5-10.

29.

PA., N., Magnetic resonance spectroscopy in the monitoring of multiple sclerosis. J Neuroimaging, 2005. 15(4 Suppl): p. 46S-57S.

30.

Neild GH, F.P., Lindon JC, Holmes EC, Nicholson JK., Uroscopy in the 21st century: high-field NMR spectroscopy. Nephrol Dial Transplant, 1997. 12(3): p. 404-17.

31.

Wang Y, H.E., Nicholson JK, Cloarec O, Chollet J, Tanner M, Singer BH, Utzinger J., Metabonomic investigations in mice infected with Schistosoma mansoni: an approach for biomarker identification. Proc Natl Acad Sci U S A, 2004. 101(34): p. 12676-81.

32.

Engelke UF, L.-v.S.M., de Jong JG, Leroy JG, Morava E, Smeitink JA, Wevers RA, N-acetylated metabolites in urine: proton nuclear magnetic resonance spectroscopic study on patients with inborn errors of metabolism. Clin Chem, 2004. 50(1): p. 58-66.

33.

Garrod S, H.E., Connor SC, Connelly JC, Spraul M, Nicholson JK, Holmes E, Highresolution (1)H NMR and magic angle spinning NMR spectroscopic investigation of the biochemical effects of 2-bromoethanamine in intact renal and hepatic tissue. Magn Reson Med, 2001. 45(5): p. 781-90.

34.

Feng J, L.X., Pei F, Chen X, Li S, Nie Y., 1H NMR analysis for metabolites in serum and urine from rats administrated chronically with La(NO3)3. Anal Biochem, 2002. 301(1): p. 1-7. 44

35.

Bales JR, H.D., Howe I, Nicholson JK, Sadler PJ, Use of high-resolution proton nuclear magnetic resonance spectroscopy for rapid multi-component analysis of urine. Clin Chem, 1984. 30(3): p. 426-32.

45

Bijlage Bijlage 1. Eliminatie breed achtergrondsignaal. Een bereid urinestaal werd na oplossen in D2O 1H-NMR spectroscopisch geanalyseerd met een 2D J-resolved 1 H NMR pulssequentie (A) en een klassieke opname (B).

A

B

10

9

8

7

6

5

4

3

2

1

δ (ppm)

Bijlage 2. Humaan gemiddeld controle spectrum. De gezonde controle spectra werden verwerkt tot een gemiddeld controle spectrum. A: aromatische regio, B: alifatische regio.

A 10

9

8

δ (ppm)

7

6

B

4

3

2

1

δ (ppm)

46

Bijlage 3. Verschil spectra MS-controle. Het gemiddeld controle spectrum werd afgetrokken van de 8 MS patiënt spectra.

MS patiënt 1

MS patiënt 2

MS patiënt 3

MS patiënt 4

10

9

8

7

6

5

4

3

2

1

4

3

2

1

ppm

MS patiënt 5

MS patiënt 6

MS patiënt 7

MS patiënt 8

10

9

8

7

6

5

δ (ppm)

47

Bijlage 4. 1H NMR spectrum van urine. Bereide urine werd na lyofiliseren heropgelost in D2O met de interne standaard TSP (0 ppm) en geanalyseerd door middel van een 400MHz klassieke 1H NMR opname. A: aromatische regio B: alifatische regio

A 10

9

8

7

6

B

4

3

2

1

δ (ppm)

humaan

A

10

9

8

7

6

5

B

4

3

2

1

δ (ppm)

rat

48

α-glucose

5,24 (d)

10

extracten hersenen

9

urine humaan (pH 5,6)

8 urine primaat + humaan (pH+/- 7,4)

7

urine rat

extracten rattennier

urine humaan ( pH 2,5)

extracten (pH 7,4)

urine muis (pH 7,4)

urine rat

1

urine humaan

Bijlage 5. Tabel chemische shiften. 2 3 4 5 6

5,23 (d) 3,92 (m)

3,86 3,79

3,81 (m)

3,73 3,54

3,55 (t)

3,44 3,42 α-ketoglutaraat acetaat

1,92

3,42 (m)

3 (t)

3,02 (t)

3,02 (t)

2,44 (t)

2,46 (t)

2,46 (t)

1,92 (s)

1,92 (s)

1,2 (s) acetoacetaat

2,61 (s)

alanine

3,77 (q)

3,77(q)

1,47 (d)

1,47 (d)

2,34 1,48

1,47

1,48 (d)

1,48 (d)

1,525 (d) allantoine

5,39 (s)

aspartaat

4,39 (dd) 3,89 (dd) 3,14 (dd) 2,95 2,8 (dd) 2,69 (dd) 2,05

β-alanine

3,32 3,18 (t) 2,56 (t) 2,32

β-glucose

4,64 (d) 4,61 (d) 3,92 (m) 3,86 3,49 3,47 (dd)

3,47 (dd)

3,4 (dd)

3,41 (dd)

3,26 (t) betaine

3,27 (t) 3,89 (s) 3,26 (s)

butyraat

1,56 0,88

49

carnosine

8,05 7,9 7,12

choline

4,07 (m) 3,96

3,94 3,5(m)

3,43 3,19 (s)

3,19

3,2

3,13 (s) citraat

2,7

2,71 2,65 (dd)

2,65 (AB)

2,65 (AB)

2,6 2,54

2,52 2,5 (dd)

creatine

3,92

3,94 (s)

3,04

3,04 (s) 3

creatinine

4,1 (s)

4,08 (s)

3,05 (s)

3,06 (s)

4,05 3,05 (s)

3,04 1,2

dihydroxyaceton

4,43 (s)

dimethylamine

2,85 (s)

dimethylglycine

3 (s)

2,75

2,73 (s)

2,94 ethanol

3,65 (q)

formaat

8,46 (s)

fosfatidylcholine

8,46 (s) 3,32 (s)

glutamaat

3,75 (t)

3,76 (t)

2,34 (t)

2,36 (dt)

2,09 (dt) 2,05 (m) glutamine

3,77 (t)

3,76 (t)

2,45 2,4

2,39 (m) 2,14

2,13 (m)

2,1 glycine

3,57

3,55 (s)

GPC

3,56 (s)

3,57 (s)

4,36 (m) 3,78 (m) 3,67 (dd) 3,24 (s)

hippuraat

3,95 (s)

7,84

7,83

7,83 (d)

7,64

7,64

7,64 (t)

7,56

7,55

7,55 (t)

3,98

3,97 (d)

3,96

3,95 (s)

histidine

8,56 (s) 8,05 7,9 7,78 (s) 7,36 (s) 7,28 (s) 7,12 7,05 (s) 4,04 (t) 4 (dd) 3,25 (dd) 3,2 (dd)

50

indoxyl sulfaat

7,69 (d) 7,49 (d) 7,35 (s) 7,29 (dd) 7,19 (dd)

isoleucine

3,65 (m) 1,96 (m) 0,99 (d) 0,91 (t)

lactaat

4,11 (q) 1,35 (d)

4,13 (q)

1,35

4,12 (q)

1,33 (d)

1,34 (d)

1,32 (d) leucine

1,3

3,69 (t)

3,7 (t)

1,72 (m) 1,69 (m)

1,7 (m) 1,66 (m)

lysine

0,96 (d)

0,96 (d)

0,94 (d)

0,94 (d)

3,74 (t)

3,75 (t)

3,01 (t)

3,02 (t)

1,975

1,89 (m)

1,9 (m)

1,75

1,69 (m)

1,7 (m)

1,45 (m)

1,47 (m)

malonaat

3,16

myo -inositol

4,1 4,07 (t)

4,06 (t)

3,61 (t)

3,62 (t)

3,54 (dd)

3,53 (dd)

3,29 (t)

3,28 (t)

3,6 3,36 3,28 3,25

N-acetyl aspartaat

4,38 (dd) 2,67 (dd) 2,48 (dd) 2,01 (s)

neopterine

2,51 2,03 (m)

2,05

2

5,2 4,7 4,6 4,44 4,34

2 oxoglutaraat

3,1 (t)

3

2,5 (t) 2,46 2 oxoisocaproaat

2,64

2 oxoisovaleraat

1,12

0,92 P-Cresol glucuronide

7,08 7,04 3,88 3,84

phenylacetylglycine

7,36 3,76 3,68

51

phenylalanine

7,4 (m)

7,4 (m)

7,31 (m)

7,32 (m)

7,35

proline

7,42 (m) 7,35 (m)

3,98 (dd)

3,98 (dd)

3,26 (dd)

3,26 (dd)

3,13 (dd)

3,13 (dd)

4,14 (t)

4,15 (t)

3,40 (t) 3,36 (t) 3,33 (t)

propionaat

2,36 (m)

2,36 (m)

2,08 (m)

2,08 (m)

2,01 (m)

2,01 (m)

2,4 (q) 2,16 1,18 (t) 1,04

pyruvaat

2,36

2,37 (s)

sarcosine

3,6 (s) 2,73 (s)

sorbitol

3,82 (q) 3,77 (t) 3,66 (d)

succinaat

2,45 (s) 2,44

2,43 (s) 2,39 (s)

taurine

3,5 (t) 3,44

3,44

3,4

3,41 (t)

3,28

3,26 (t)

3,42 (t)

3,43 (t)

3,26 (t)

3,28 (t)

3,35 (t) 3,31 3,24

3,26

3,25

threonine

4,26 (q) 4,25 (m)

trimethylamine-N-oxide

3,58 (d)

3,59 (d)

1,32 (d)

1,32 (d)

3,44 (s) 3,3 (s)

3,3 (s) 3,25

3,26 (s)

trimethyl amine

2,88

tryptophan

7,71

7,73 (d)

7,52

7,54 (d)

7,28

7,28 (t)

7,31(s) 7,24

7,2 (t) 4,05 (dd) 3,48 (dd) 3,31 (dd)

tyrosine

7,18 (d)

7,17(d)

6,88 (d)

6,87 (d)

6,89 (m)

3,97 (dd) 3,93 (dd) 3,15 (dd)

3,14 (dd)

3,05 (dd)

3,06 (dd)

52

uracil

7,72 (d) 5,82 (d)

urea

5,8

valine 1,05 (dd)

3,61 (d)

3,61 (d)

2,27 (m)

2,28 (m)

1,04 (d)

1,02 (d)

0,99 (d) vetten

0,97 (d) 2,79 (m) 1,27 (m) 0,87 (m)

Singlet (s), doublet (d), triplet (t), quadruplet (q), multiplet (m) doublet van doubletten (dd) Bronnen: 1 [30], 2 [31], 3 [5], 4 [21], 5 [32], 6 [33], 7 [34], 8 [17], 9 [35], 10 [10]

53

Auteursrechterlijke overeenkomst Opdat de Universiteit Hasselt uw eindverhandeling wereldwijd kan reproduceren, vertalen en distribueren is uw akkoord voor deze overeenkomst noodzakelijk. Gelieve de tijd te nemen om deze overeenkomst door te nemen en uw akkoord te verlenen.

Ik/wij verlenen het wereldwijde auteursrecht voor de ingediende eindverhandeling: Opsporen van ziektemerkers in biofluids door middel van NMR spectroscopie Richting: Master in de biomedische wetenschappen Jaar: 2006 in alle mogelijke mediaformaten, - bestaande en in de toekomst te ontwikkelen - , aan de Universiteit Hasselt. Deze toekenning van het auteursrecht aan de Universiteit Hasselt houdt in dat ik/wij als auteur de eindverhandeling, - in zijn geheel of gedeeltelijk -, vrij kan reproduceren, (her)publiceren of distribueren zonder de toelating te moeten verkrijgen van de Universiteit Hasselt. U bevestigt dat de eindverhandeling uw origineel werk is, en dat u het recht heeft om de rechten te verlenen die in deze overeenkomst worden beschreven. U verklaart tevens dat de eindverhandeling, naar uw weten, het auteursrecht van anderen niet overtreedt. U verklaart tevens dat u voor het materiaal in de eindverhandeling dat beschermd wordt door het auteursrecht, de nodige toelatingen hebt verkregen zodat u deze ook aan de Universiteit Hasselt kan overdragen en dat dit duidelijk in de tekst en inhoud van de eindverhandeling werd genotificeerd. Universiteit Hasselt zal u als auteur(s) van de eindverhandeling identificeren en zal geen wijzigingen aanbrengen aan de eindverhandeling, uitgezonderd deze toegelaten door deze licentie

Ik ga akkoord,

Peter REDANT Datum:

Lsarev_autr

léëéçêéå=î~å=òáéâíéãéêâéêë=áå=äáçñäìáçë=çççê=ãáççéä= î~å=kjo=ëééåíêçëåçéáé - PDF Free Download (2024)
Top Articles
Latest Posts
Recommended Articles
Article information

Author: Laurine Ryan

Last Updated:

Views: 5819

Rating: 4.7 / 5 (57 voted)

Reviews: 88% of readers found this page helpful

Author information

Name: Laurine Ryan

Birthday: 1994-12-23

Address: Suite 751 871 Lissette Throughway, West Kittie, NH 41603

Phone: +2366831109631

Job: Sales Producer

Hobby: Creative writing, Motor sports, Do it yourself, Skateboarding, Coffee roasting, Calligraphy, Stand-up comedy

Introduction: My name is Laurine Ryan, I am a adorable, fair, graceful, spotless, gorgeous, homely, cooperative person who loves writing and wants to share my knowledge and understanding with you.